1997年03月, 東京大学, 博士（理学）

1990年04月, 1992年03月, 東京大学, 理学系研究科, 化学専攻

1986年04月, 1990年03月, 東京大学, 理学部, 化学科

博士（理学）

日本生物物理学会

日本化学会

日本生化学会

日本蛋白質科学会

2009年04月, 9999年, 群馬大学, 大学院工学研究科／大学院理工学府, 教授, 教授相当

2004年11月, 2009年03月, 名古屋大学, 大学院工学研究科, 助教授、准教授

2003年07月, 2004年10月, 名古屋大学, 大学院工学研究科, 助手, 研究・教育補助者相当

1998年06月, 2003年06月, 東京農工大学, 工学部生命工学科, 助手, 研究・教育補助者相当

1993年04月, 1998年05月, 東レ株式会社（東レリサーチセンター 構造化学研究部）

1992年04月, 1993年03月, 東京農工大学, 工学部物質・生命工学科, 助手, 研究・教育補助者相当

ナノテク・材料, 生物分子化学

ライフサイエンス, 生物物理学

ナノテク・材料, 基礎物理化学

脂質二分子膜

フッ素化

膜タンパク質

微生物ロドプシン

脂質結合タンパク質

ABCトランスポーター

光受容膜タンパク質

レーザーフラッシュホトリシス

赤外分光

Phonon modes controlled by primary chemical structure of partially fluorinated dimyristoylphosphatidylcholine (DMPC) revealed by multiple-angle incidence resolution spectrometry (MAIRS), Takeshi Hasegawa ; Ai Nakagawara; Toshiyuki Takagi; Takafumi Shimoaka; Nobutaka Shioya; Masashi Sonoyama, 2024年02月, J. Chem. Phys., 160, 064704, 研究論文（学術雑誌）

Thermodynamic Study on Hydrated Bilayers of Ether-linked Phosphatidylcholines with Terminal Perfluorobutyl Group, Miyazaki, M., Arisaka, C., Nakagawara, A., Sasaki, N., Takahashi, H., Takagi, T., Amii, H., and Sonoyama, M., 2024年02月, Biochim. Biophys. Acta (BBA) Biomembr., 1866, 2, 184261, 研究論文（学術雑誌）

部分フッ素化リン脂質二分子膜 ～物性・構造と膜タンパク質研究への展開～, 園山 正史; 高木 俊之; 高橋 浩, 2019年11月, 生物物理, Seibutsubutsuri, 59, 6, 310, 313, 研究論文（学術雑誌）

部分フッ素化リン脂質の合成とその膜構造・物性および膜タンパク質研究への展望, 高橋浩; 高木俊之; 園山正史, 2019年04月, 膜(MEMBRANE), MAKU(MEMBRANE), 44, 2, 50, 56, 研究論文（学術雑誌）

膜タンパク質研究への展開をめざした部分フッ素化リン脂質膜の開発, 園山正史, 2016年, オレオサイエンス, 16, 3, 137, 143, 研究論文（学術雑誌）

Experimental and theoretical investigations into the mechanism of interactions between membrane-bound fatty acids and their binding protein: A model system to investigate the behavior of lipid acyl chains in contact with proteins, Shigeru Sugiyama, Daisuke Matsuoka, Toshiaki Hara, Masashi Sonoyama, Shigeru Matsuoka, and Michio Murata, 2022年08月, Chem Phys. Lipids, 研究論文（学術雑誌）

Hydrophobic alpha-helical short peptides in overlapping reading frames of the coronavirus genome, Takashi Okura, Kazuya Shirato, Masatoshi Kakizaki, Satoko Sugimoto, Shutoku Matsuyama, Tomohisa Tanaka, Yohei Kume, Mina Chishiki, Takashi Ono, Kohji Moriishi, Masashi Sonoyama, Mitsuaki Hosoya, Koichi Hashimoto, Katsumi Maenaka, and Makoto Takeda, 2022年08月, Pathogens, 11, 877, 研究論文（学術雑誌）

Toxicity of internalized polyalanine to cells depends on aggregation, Yutaro Iizuka, Ryuji Owada, Takayasu Kawasaki, Fumio Hayashi, Masashi Sonoyama, and Kazuhiro Nakamura, 2021年12月, Scientific Reports, 11, 23441, 研究論文（学術雑誌）

Comparison of Functionality and Structural Stability of Bacteriorhodopsin Reconstituted in Partially Fluorinated Dimyristoylphosphatidylcholine Liposomes with Different Perfluoroalkyl Chain Lengths, Mami Hashimoto; Yuka Murai; Kohei Morita; Takashi Kikukawa; Toshiyuki Takagi; Hiroshi Takahashi; Yasunori Yokoyama; Hideki Amii; Masashi Sonoyama, 2021年10月, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, 1863, 183686, 研究論文（学術雑誌）

Membrane properties of amacrocyclic tetraether bisphosphatidylcholine lipid: Effect of a single membrane-spanning polymethylene cross-linkage between two head groups of ditetradecylphosphatidylcholine, Naoyuki Tsuchida, Toshiyuki Takagi, Hiroshi Takahashi, Toshitada Yoshihara, Seiji Tobita, Masashi Sonoyama, 2021年05月, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, 1863, 5, 研究論文（学術雑誌）

Pore size distributions related with spontaneous purple membrane stacking in porous hydrogels, Morise Karasawa, Yasunori Yokoyama, Kingo Takiguchi, Hiroshi Takahashi, Takashi Kikukawa, Masashi Sonoyama and Koshi Takenaka, 2021年10月, Journal of the Physical Society of Japan (JPSJ), 90, 103801, 研究論文（学術雑誌）

Effects of salt and gel network structures on purple membrane stacking in hydrogels immobilized with poly(vinyl alcohol), Yasunori Yokoyama, Shunsuke Yano, Riku Kurita, Morise Karasawa, Hikaru Tanaka, Hiroshi Takahashi, Takashi Kikukawa, Masashi Sonoyama, Koshi Takenaka, 2021年01月04日, Journal of Applied Physics, 129, 1, 014701, 研究論文（学術雑誌）

Thermotropic transition behaviors of novel partially fluorinated dimyristoylphosphatidylcholines with different perfluoroalkyl chain lengths, Kohei Morira; Miki Horikoshi; Tamami Yanagi; Toshiyuki Takagi; Hiroshi Takahashi; Hideki Amii; Takeshi Hasegawa; Masashi Sonoyama, 2019年06月, Chem. Lett., 48, 9, 1105, 1108, 研究論文（学術雑誌）

Raman Optical Activity on a Solid Sample: Identification of Atropisomers of Perfluoroalkyl Chains Having a Helical Conformation and No Chiral Center, Shimoaka, Takafumi; Sonoyama, Masashi; Amii, Hideki; Takagi, Toshiyuki; Kanamori, Toshiyuki; Hasegawa, Takeshi, 2019年05月, JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, 123, 18, 3985, 3991, 研究論文（学術雑誌）

Fluorous Property of a Short Perfluoroalkyl-Containing Compound Realized by Self-Assembled Monolayer Technique on a Silicon Substrate, Kise, Ryuma; Fukumi, Aki; Shioya, Nobutaka; Shimoaka, Takafumi; Sonoyama, Masashi; Amii, Hideki; Takagi, Toshiyuki; Kanamori, Toshiyuki; Eda, Kazuo; Hasegawa, Takeshi, 2019年04月, BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN, 92, 4, 785, 789, 研究論文（学術雑誌）

Comparison of two different partially fluorinated phosphatidylcholines with perfluorobutyl group on thermotropic properties of bilayer membrane and reconstituted bacteriorhodopsin, Tamami Yanagi; Toshiyuki Takagi; Hiroshi Takahashi; Takashi Kikukawa; Hideki Amii; Masashi Sonoyama, 2019年05月, Biophysical Reviews, 11, 3, 395, 398, 研究論文（学術雑誌）

Stability of the Two-Dimensional Lattice of Bacteriorhodopsin Reconstituted in Partially Fluorinated Phosphatidylcholine Bilayers, Hiroshi Takahashi; Masaru Yoshino; Kohei Morita; Toshiyuki Takagi; Yasunori Yokoyama; Takashi Kikukawa; Hideki Amii; Toshiyuki Kanamori; Masashi Sonoyama, 2019年03月, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes, 1861, 3, 631, 642, 研究論文（学術雑誌）

Study of Perfluoroalkyl Chain-Specific Band Shift in Infrared Spectra on the Chain Length, Takafumi Shimoaka; Masashi Sonoyama; Hideki Amii; Toshiyuki Takagi; Toshiyuki Kanamori; Takeshi Hasegawa, 2017年11月, JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, 121, 44, 8425, 8431, 研究論文（学術雑誌）

Spontaneous stacking of purple membranes during immobilization with physical cross-linked poly(vinyl alcohol) hydrogel with retaining native-like functionality of bacteriorhodopsin, Yasunori Yokoyama; Hikaru Tanaka; Shunsuke Yano; Hiroshi Takahashi; Takashi Kikukawa; Masashi Sonoyama; Koshi Takenaka, 2017年05月, JOURNAL OF APPLIED PHYSICS, 121, 20, 204701, 研究論文（学術雑誌）

Surface properties of a single perfluoroalkyl group on water surfaces studied by surface potential measurements, Takafumi Shimoaka; Yuki Tanaka; Nobutaka Shioya; Kohei Morita; Masashi Sonoyama; Hideki Amii; Toshiyuki Takagi; Toshiyuki Kanamori; Takeshi Hasegawa, 2016年12月, JOURNAL OF COLLOID AND INTERFACE SCIENCE, 483, 353, 359, 研究論文（学術雑誌）

Lateral Diffusion and Molecular Interaction in a Bilayer Membrane Consisting of Partially Fluorinated Phospholipids, Yoshiaki Okamoto; Toshinori Motegi; Kohei Morita; Toshiyuki Takagi; Hideki Amii; Toshiyuki Kanamori; Masashi Sonoyama; Ryugo Tero, 2016年10月, LANGMUIR, 32, 41, 10712, 10718, 研究論文（学術雑誌）

Evaluation of diacylphospholipids as boundary lipids for bacteriorhodopsin from structural and functional aspects, Satoshi Kawatake; Yuichi Umegawa; Shigeru Matsuoka; Michio Murata; Masashi Sonoyama, 2016年09月, BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-BIOMEMBRANES, 1858, 9, 2106, 2115, 研究論文（学術雑誌）

An Origin of Complicated Infrared Spectra of Perfluoroalkyl Compounds Involving a Normal Alkyl Group, Takeshi Hasegawa; Takafumi Shimoaka; Yuki Tanaka; Nobutaka Shioya; Kohei Morita; Masashi Sonoyama; Hideki Amii; Toshiyuki Takagi; Toshiyuki Kanamori, 2015年06月, CHEMISTRY LETTERS, 44, 6, 834, 836, 研究論文（学術雑誌）

Strong Interaction of Bovine Brain Calmodulin with Bisphenol A: Effects on Secondary Structure, Conformation, Ca2+-Binding Affinity, Gibbs Energy, and Domain Cooperativity, Koichi Murayama; Masashi Sonoyama; Sadayuki Matsuda, 2015年06月, BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN, 88, 6, 880, 887, 研究論文（学術雑誌）

Stratified Dipole-Arrays Model Accounting for Bulk Properties Specific to Perfluoroalkyl Compounds, Takeshi Hasegawa; Takafumi Shimoaka; Nobutaka Shioya; Kohei Morita; Masashi Sonoyama; Toshiyuki Takagi; Toshiyuki Kanamori, 2014年10月, CHEMPLUSCHEM, 79, 10, 1421, 1425, 研究論文（学術雑誌）

Dependence of Purple Membrane Bump Curvature on pH and Ionic Strength Analyzed Using Atomic Force Microscopy Combined with Solvent Exchange, Yasunori Yokoyama; Kosuke Yamada; Yosuke Higashi; Satoshi Ozaki; Haorang Wang; Naoki Koito; Naoya Watanabe; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2014年08月, JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 118, 31, 9322, 9328, 研究論文（学術雑誌）

Physicochemical Studies of Bacteriorhodopsin Reconstituted in Partially Fluorinated Phosphatidylcholine Bilayers, Masaru Yoshino; Takashi Kikukawa; Hiroshi Takahashi; Toshiyuki Takagi; Yasunori Yokoyama; Hideki Amii; Teruhiko Baba; Toshiyuki Kanamori; Masashi Sonoyama, 2013年05月, JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 117, 18, 5422, 5429, 研究論文（学術雑誌）

Non-ideal mixing of dimyristoylphosphatidylcholine with its partially fluorinated analogue in hydrated bilayers, Hiroshi Takahashi; Masaru Yoshino; Toshiyuki Takagi; Hideki Amii; Teruhiko Baba; Toshiyuki Kanamori; Masashi Sonoyama, 2013年02月, CHEMICAL PHYSICS LETTERS, 559, 107, 111, 研究論文（学術雑誌）

Effect of Partial Fluorination in the Myristoyl Groups on Thermal and Interfacial Properties of Dimyristoylphosphatidylcholine, Masaru Yoshino; Hiroshi Takahashi; Toshiyuki Takagi; Teruhiko Baba; Kohei Morita; Hideki Amii; Toshiyuki Kanamori; Masashi Sonoyama, 2012年11月, CHEMISTRY LETTERS, 41, 11, 1495, 1497, 研究論文（学術雑誌）

Solubilization and Structural Stability of Bacteriorhodopsin with a Mild Nonionic Detergent, n-Octyl-beta-thioglucoside, Azusa Asada; Masashi Sonoyama, 2011年02月, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 75, 2, 376, 378, 研究論文（学術雑誌）

Effect of Lipid Phase Transition on Molecular Assembly and Structural Stability of Bacteriorhodopsin Reconstituted into Phosphatidylcholine Liposomes with Different Acyl-Chain Lengths, Yasunori Yokoyama; Lumi Negishi; Taku Kitoh; Masashi Sonoyama; Yasuo Asami; Shigeki Mitaku, 2010年12月, JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 114, 47, 15706, 15711, 研究論文（学術雑誌）

Highly Stable Solubilization of Membrane Protein Bacteriorhodopsin with a Short-chain Phospholipid Diheptanoylphosphatidylcholine, Masashi Sonoyama; Mina Fukumoto; Yumiko Kuwabara, 2010年08月, CHEMISTRY LETTERS, 39, 8, 876, 877, 研究論文（学術雑誌）

Structural Changes in Bacteriorhodopsin in Purple Membranes Induced by Irreversible Photobleaching with Heterogeneous and Homogeneous Stability, Yasunori Yokoyama; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2010年03月, PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY, 86, 2, 297, 301, 研究論文（学術雑誌）

Effect of Molecular Assembly on Photocycle of Reconstituted Bacteriorhodopsin: Significant Blue Shift of the Late M Photointermediate in the Liquid Crystalline Phase, Masashi Sonoyama; Takashi Kikukawa; Yasunori Yokoyama; Makoto Demura; Naoki Kamo; Shigeki Mitaku, 2009年12月, CHEMISTRY LETTERS, 38, 12, 1134, 1135, 研究論文（学術雑誌）

Bisphenol A Weakens Calcium Binding Affinity of Sites III and IV in C-Terminal Domain of Bovine Brain Calmodulin, Koichi Murayama; Masashi Sonoyama; Tomoyoshi Terada; Yasunori Yokoyama; Masayuki Nara; Mihoko Tomida; Sadayuki Matsuda, 2009年11月, CHEMISTRY LETTERS, 38, 11, 1062, 1063, 研究論文（学術雑誌）

Raman optical activity of flagellar filaments of Salmonella: Unusually intense ROA from L-type self-assembled protein filaments and their possible higher level chiral organization, Tomonori Uchiyama; Masashi Sonoyama; Yoshiaki Hamada; Rina K. Dukor; Laurence A. Nafie; Fumio Hayashi; Kenji Oosawa, 2008年09月, VIBRATIONAL SPECTROSCOPY, 48, 1, 65, 68, 研究論文（学術雑誌）

Reconstitution of bacteriorhodopsin into cyclic lipid vesicles, Motonari Shibakami; Hisayoshi Tsuihiji; Shin Miyoshi; Makoto Nakamura; Rie Goto; Shigeki Mitaku; Masashi Sonoyama, 2008年06月, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 72, 6, 1623, 1625, 研究論文（学術雑誌）

Vertebrate genomes code excess proteins with charge periodicity of 28 residues, Runcong Ke; Noriyuki Sakiyama; Ryusuke Sawada; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2008年05月, JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 143, 5, 661, 665, 研究論文（学術雑誌）

Nuclear localization of proteins with a charge periodicity of 28 residues, Noriyuki Sakiyama; Runcong Ke; Ryuusuke Sawada; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2008年01月12日, Chem-Bio Informatics Journal, 7, 2, 35, 48, 研究論文（学術雑誌）

SOSUI-GramN: high performance prediction for sub-cellular localization of proteins in Gram-negative bacteria, Imai Kenichiro; Asakawa Naoyuki; Tsuji Toshiyuki; Akazawa Fumitsugu; Ino Ayano; Sonoyama Masashi; Mitaku Shigeki, 2008年, Bioinformation, 2, 9, 417, 421

Physicochemical properties of GPCR amino acid sequences for understanding GPCR-G-protein coupling, Ganga D. Ghimire; Hideki Tanizawa; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2008年, Chem-Bio Informatics Journal, 8, 2, 49, 57, 研究論文（学術雑誌）

Structural change of bacteriorhodopsin in the purple membrane above pH 10 decreases heterogeneity of the irreversible photobleaching components, Yasunori Yokoyama; Masashi Sonoyama; Tatsuhiko Nakano; Shigeki Mitaku, 2007年09月, JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 142, 3, 325, 333, 研究論文（学術雑誌）

Human genome encodes many proteins with charge periodicity of 28 residues, Runcong Ke; Noriyuki Sakiyama; Ryusuke Sawada; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2007年09月, JAPANESE JOURNAL OF APPLIED PHYSICS PART 1-REGULAR PAPERS BRIEF COMMUNICATIONS & REVIEW PAPERS, 46, 9A, 6083, 6086, 研究論文（学術雑誌）

In-situ observation of tryptophan in larval cocoon silk of the hornet Vespa simillima xanthoptera Cameron by ultraviolet resonance Raman spectroscopy, Tsunenori Kameda; Tomotake Nuzeki; Masashi Sonoyama, 2007年05月, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 71, 5, 1353, 1355, 研究論文（学術雑誌）

A fourth type of secondary structure breaker, Imai Kenichiro; Sonoyama Masashi; Mitaku Shigeki; Kaneda Y; Kawamura H; Sasai M, 2007年, Frontiers of Computational Science, 165, 170

Nuclear proteins with charge periodicity of 28 residues are specifically increased in vertebrate genomes, Noriyuki Sakiyama; Runcong Ke; Ryuusuke Sawada; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2007年, Chem-Bio Informatics Journal, 7, 3, 69, 78, 研究論文（学術雑誌）

Ratio of membrane proteins in total proteomes of prokaryota, Ryusuke Sawada; Runcong Ke; Toshiyuki Tsuji; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2007年, Biophysics, 3, 37, 45, 研究論文（学術雑誌）

Raman spectroscopic study on the L-type straight flagellar filament of Salmonella, Tomonori Uchiyama; Masashi Sonoyama; Yoshiaki Hamada; Mamoru Komatsu; Rina K. Dukor; Laurence A. Nafie; Kenji Oosawa, 2006年11月, VIBRATIONAL SPECTROSCOPY, 42, 2, 192, 194, 研究論文（学術雑誌）

Structures of 17,19-hexatriacontadiyne monolayers on Au(111) studied by infrared reflection absorption spectroscopy and scanning tunneling microscopy, Osamu Endo; Taro Furuta; Hiroyuki Ozaki; Masashi Sonoyama; Yasuhiro Mazaki, 2006年07月06日, Journal of Physical Chemistry B, 110, 26, 13100, 13106, 研究論文（学術雑誌）

Heterogeneity in regeneration of bacteriorhodopsin from bacterio-opsin and all-trans retinal at high temperatures: Implications for dynamic structural fluctuations, Hiroyuki Sugiyama; Masashi Sonoyama; Ganga D. Ghimire; Shigeki Mitaku, 2006年06月, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 70, 6, 1350, 1355, 研究論文（学術雑誌）

Physicochemical properties of amino acid sequences of G-proteins for understanding GPCR-G-protein coupling, Ganga D. Ghimire; Kenichiro Imai; Fumitsugu Akazawa; Toshiyuki Tsuji; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2006年05月19日, Chem-Bio Informatics Journal, 6, 1, 1, 16, 研究論文（学術雑誌）

Comparative proteomics of the prokaryota using secretory proteins, Masahiro Gomi; Ryusuke Sawada; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2006年02月08日, Chem-Bio Informatics Journal, 5, 3, 56, 64, 研究論文（学術雑誌）

Secondary structure breakers and hairpin structures in myoglobin and hemoglobin, Kenichiro Imai; Naoyuki Asakawa; Toshiyuki Tsuji; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2006年02月08日, Chem-Bio Informatics Journal, 5, 3, 65, 77, 研究論文（学術雑誌）

Photobleaching of bacteriorhodopsin solubilized with Triton X-100, T Sasaki; M Sonoyama; M Demura; S Mitaku, 2005年09月, PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY, 81, 5, 1131, 1137, 研究論文（学術雑誌）

Electric charge balance mechanism of extended soluble proteins, N Uchikoga; SY Takahashi; RC Ke; M Sonoyama; S Mitaku, 2005年01月, PROTEIN SCIENCE, 14, 1, 74, 80, 研究論文（学術雑誌）

Regeneration of bacteriorhodopsin from thermally unfolded bacterio-opsin and all-trans retinal at high temperatures, GD Ghimire; H Sugiyama; M Sonoyama; S Mitaku, 2005年01月, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 69, 1, 252, 254, 研究論文（学術雑誌）

Regeneration of bacteriorhodopsin from thermally unfolded bacterio-opsin and all-trans retinal at high temperatures, GD Ghimire; H Sugiyama; M Sonoyama; S Mitaku, 2005年01月, BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY, 69, 1, 252, 254, 研究論文（学術雑誌）

High-temperature intermediate state of bacteriorhodopsin prior to the premelting transition of purple membrane revealed by reactivity with hydrolysis reagent hydroxylamine, M Sonoyama; S Mitaku, 2004年12月, JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B, 108, 50, 19496, 19500, 研究論文（学術雑誌）

Thermotropic behavior of membranes containing DMPC and chemically and stereochemically pure sphingomyelin upon cholesterol addition, M Shibakami; M Sonoyama; R Goto; M Mori; H Suzuki; S Mitaku, 2004年12月, JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN, 73, 12, 3484, 3488, 研究論文（学術雑誌）

"Edge-on" orientation of alkyl chains on an iodine-covered Au(111) surface studied by infrared reflection absorption spectroscopy, O Endo; Y Fukushima; H Ozaki; M Sonoyama; H Tukada, 2004年10月, SURFACE SCIENCE, 569, 1-3, 99, 104, 研究論文（学術雑誌）

Isomerization of retinal chromophore and conformational changes in membrane protein bacteriorhodopsin by solubilization with a mild non-ionic detergent, n-octyl-beta-glucoside: an FT-Raman and FT-IR spectroscopic study, M Sonoyama; T Hasegawa; T Nakano; S Mitaku, 2004年06月, VIBRATIONAL SPECTROSCOPY, 35, 1-2, 115, 119, 研究論文（学術雑誌）

Isomerization of retinal chromophore and conformational changes in membrane protein bacteriorhodopsin by solubilization with a mild non-ionic detergent, n-octyl-beta-glucoside: an FT-Raman and FT-IR spectroscopic study, M Sonoyama; T Hasegawa; T Nakano; S Mitaku, 2004年06月, VIBRATIONAL SPECTROSCOPY, 35, 1-2, 115, 119, 研究論文（学術雑誌）

Spectroscopic characterization of heterogeneous structure of Samia cynthia ricini silk fibroin induced by stretching and molecular dynamics simulation, MY Yang; JM Yao; M Sonoyama; T Asakura, 2004年05月, MACROMOLECULES, 37, 9, 3497, 3504, 研究論文（学術雑誌）

Inhomogeneous stability of bacteriorhodopsin in purple membrane against photobleaching at high temperature, Y Yokoyama; M Sonoyama; S Mitaku, 2004年02月, PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 54, 3, 442, 454, 研究論文（学術雑誌）

High performance system for signal peptide prediction: SOSUIsignal, Masahiro Gomi; Masashi Sonoyama; Shigeki Mitaku, 2004年, Chem-Bio Informatics Journal, 4, 4, 142, 147, 研究論文（学術雑誌）

Raman spectrum of model peptide (Ala-Gly)(15) for Bombyx mori silk fibroin with Silk I form and theoretical calculation according to repeated beta-turn type II structural model., T Yamane; M Sonoyama; T Asakura; Y Furukawa, 2002年09月, SEN-I GAKKAISHI, 58, 9, 327, 331, 研究論文（学術雑誌）

Irreversible photobleaching of bacteriorhodopsin in a high-temperature intermediate state, Y Yokoyama; M Sonoyama; S Mitaku, 2002年06月, JOURNAL OF BIOCHEMISTRY, 131, 6, 785, 790, 研究論文（学術雑誌）

Analysis of thermal phase transition via time-resolved infrared spectra using partial least-squares regression modeling parameters, T Hasegawa; J Nishijo; M Sonoyama; T Nakano, 2002年03月, APPLIED SPECTROSCOPY, 56, 3, 288, 294, 研究論文（学術雑誌）

Characterization of water contribution to excimer laser ablation of collagen, K Tsunoda; M Sugiura; M Sonoyama; H Yajima; T Ishii; J Taniyama; H Itoh, 2001年12月, JOURNAL OF PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY A-CHEMISTRY, 145, 3, 195, 200, 研究論文（学術雑誌）

Effect of carbonic anhydrase II in molten globule state on physical properties of dimyristoylphosphatidylcholine liposome, H Sakai; M Tanaka; K Imai; M Sonoyama; S Mitaku, 2001年05月, JAPANESE JOURNAL OF APPLIED PHYSICS PART 1-REGULAR PAPERS SHORT NOTES & REVIEW PAPERS, 40, 5B, 3521, 3525, 研究論文（学術雑誌）

Infrared rheo-optics of Bombyx mori fibroin film by dynamic step-scan FT-IR spectroscopy combined with digital signal processing, M Sonoyama; T Nakano, 2000年07月, APPLIED SPECTROSCOPY, 54, 7, 968, 973, 研究論文（学術雑誌）

First observation of precursory structural changes of aliphatic parts in the alpha-gamma polymorphic transition of DL-norleucine by temperature-scanning time-resolved FT-IR spectroscopy, M Sonoyama; H Yajima; T Nakano; M Matsumoto; Tsukushi, I; T Ishii, 2000年05月, CHEMISTRY LETTERS, 5, 558, 559, 研究論文（学術雑誌）

Ultrasonic properties of a binary system of a soluble protein, alpha-lactalbumin and dimyristoyl phosphatidylcholine membrane, H Sakai; K Imai; M Tanaka; M Sonoyama; S Mitaku, 2000年05月, JAPANESE JOURNAL OF APPLIED PHYSICS PART 1-REGULAR PAPERS SHORT NOTES & REVIEW PAPERS, 39, 5B, 2948, 2949, 研究論文（学術雑誌）

FT-IR studies on secondary structures of wild silkworm fibroin films, Miyazawa Mitsuhiro; Sonoyama Masashi; Saito H, 2000年, Int. J. Wild Silkmoth & Silk, Int. J. Wild Silkmoth & Silk, 5, 47, 50

Proportion of membrane proteins in proteomes of 15 single-cell organisms analyzed by the SOSUI prediction system, S Mitaku; M Ono; T Hirokawa; S Boon-Chieng; M Sonoyama, 1999年12月, BIOPHYSICAL CHEMISTRY, 82, 2-3, 165, 171, 研究論文（学術雑誌）

Dynamic FT-IR spectoscopies of polymeric materials under external perturbation, 1999年, Recent Research Developments in Applied Spectroscopy, 2, 113, 124

Second derivative near infrared studies on the structural characterisation of proteins, M Miyazawa; M Sonoyama, 1998年, JOURNAL OF NEAR INFRARED SPECTROSCOPY, VOL 6 1998, 6, 1-4, A253, A257, 研究論文（国際会議プロシーディングス）

Carbohydrate analysis of porcine thyroglobulin isoforms with different iodine contents, M Ikekita; H Yajima; T Murata; K Takatera; T Watanabe; M Sonoyama; Y Tezuka; T Ishii; O Tarutani, 1997年10月, BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, 1336, 3, 557, 565, 研究論文（学術雑誌）

Carbohydrate analysis of porcine thyroglobulin isoforms with different iodine contents, M Ikekita; H Yajima; T Murata; K Takatera; T Watanabe; M Sonoyama; Y Tezuka; T Ishii; O Tarutani, 1997年10月, BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-GENERAL SUBJECTS, 1336, 3, 557, 565, 研究論文（学術雑誌）

Dynamic FT-IR spectroscopic studies of silk fibroin films, M Sonoyama; M Miyazawa; G Katagiri; H Ishida, 1997年04月, APPLIED SPECTROSCOPY, 51, 4, 545, 547, 研究論文（学術雑誌）

Amplitude spectrum analysis of dynamic FT-IR spectra of uniaxially drawn poly(ethylene terephthalate) film with a variable-temperature polymer stretcher, M Sonoyama; K Shoda; G Katagiri; H Ishida; T Nakano; S Shimada; T Yokoyama; H Toriumi, 1997年04月, APPLIED SPECTROSCOPY, 51, 4, 598, 600, 研究論文（学術雑誌）

Amplitude spectrum approach in dynamic FT-IR spectroscopy of uniaxially oriented poly(ethylene terephthalate) films .1. Draw ratio dependence, M Sonoyama; K Shoda; G Katagiri; H Ishida, 1997年03月, APPLIED SPECTROSCOPY, 51, 3, 346, 349, 研究論文（学術雑誌）

Secondary structure of hog thyroglobulins with different iodine content, Yajima Hirofumi; Ishii Tadashi; Ikekita Masahiko; Taketera Kikuo; Watanabe Tadashi; Sonoyama Masashi; Tarutani Osamu, 1997年, Res. Comm. Biochem. Cell. Mol. Biol., Res. Comm. Biochem. Cell. Mol. Biol., 1, 2-3, 171, 184

Secondary structure and thermostability of the photosystem II manganese-stabilizing protein of the thermophilic cyanobacterium Synechococcus elongatus, M Sonoyama; A Motoki; G Okamoto; M Hirano; H Ishida; S Katoh, 1996年10月, BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEIN STRUCTURE AND MOLECULAR ENZYMOLOGY, 1297, 2, 167, 170, 研究論文（学術雑誌）

Dynamic step-scan two-dimensional Fourier transform infrared studies of uniaxially drawn poly(ethylene terephthalate) film, M Sonoyama; K Shoda; G Katagiri; H Ishida, 1996年03月, APPLIED SPECTROSCOPY, 50, 3, 377, 381, 研究論文（学術雑誌）

NIR studies of fibroin secondary structures, Mitsuhiro MIYAZAWA; Masashi SONOYAMA, 1995年, J. Spectrosc. Soc. Jpn., 44, 5, 254, 256

Conformational adaptability of the terminal regions of flagellin, F. Vonderviszt, M. Sonoyoama, M. Tasumi, K. Namba, 1992年12月, BIOPHYSICAL JOURNAL, 63, 6, 1672, 1677

CSJカレントレビュー第46号 フッ素原子の特性を活かした分子変換・材料開発の新手法・新展開　「4章　部分フッ素化リン脂質膜の生物物理化学」, 分担執筆, 園山正史, 化学同人, 2023年11月30日, 学術書

膜タンパク質工学ハンドブック 第1編 膜タンパク質の基礎 『5 膜タンパク質を対象としたアミノ酸配列解析とその応用』, 共編者(共編著者), 越中谷 賢治・向井 有理・園山 正史（分担執筆）, エヌ・ティー・エス, 2020年, 41-46, ISBN: 9784860435370

生命工学への招待 １５．ヒトゲノム解析とその応用, 朝倉書店, 2002年

実用分光法シリーズ 赤外分光法 ６．５ 二次元赤外分光法, アイピーシー出版, 1998年

陸生アクチノバクテリア由来新規微生物ロドプシン群の発見, 上野 真琴・林 史夫・菊川 峰志・園山 正史, バイオインタラクション研究会第19回ワークショップ, 2022年12月12日

部分フッ素化リン脂質を用いた膜タンパク質研究の展開, 園山 正史, バイオインタラクション研究会 第16回ワークショップ, 2022年03月07日, 日本語, 京都, 国内会議

Partially Fluorinated Phospholipid Membrane, Masashi SONOYAMA, 第58回日本生物物理学会年会, 2020年09月17日, 2020年09月16日, 2020年09月18日, 英語

Partially Fluorinated Phosphatidylcholine Bilayer, SONOYAMA Masashi, 16th International Conference on Flow Dynamics (ICFD2019), 2019年11月08日, 英語, 国際会議

部分フッ素化リン脂質二分子膜 〜物性・構造の特徴と膜タンパク質研究への展開〜, 園山 正史, 高知大学研究会「生体膜を含む生体分子間相互作用研究の現状と課題」, 2019年08月09日, 日本語, 国内会議

パーフルオロアルキル基を疎水鎖末端に導入した部分フッ素化リン脂質ライブラリーの開発とin vitro膜タンパク質研究への展開, 園山 正史, フルオラス科学研究会第10回シンポジウム（東京）, 2017年10月13日

部分フッ素化リン脂質のfluorophilic effectを利用したin vitro膜タンパク質研究の展開, 園山 正史, 日本薬学会第137年会 「S12脂質結合タンパク質の構造生物学—最近の展開—」, 2017年03月25日, 日本語, 国内会議

パーフルオロアルキル基を含むリン脂質を用いたin vitro膜タンパク質研究の展開, 園山 正史, 第16回日本蛋白質科学会年会 「1WE-1 脂質-タンパク質の相互作用研究の新展開」, 2016年06月07日

Development of Novel Partially Fluorinated Phospholipid Membrane for Biophysical Studies of Membrane Proteins, Masashi SONOYAMA, 第53回日本生物物理学会年会, 2015年09月14日

部分フッ素化リン脂質ライブラリーの開発 〜膜タンパク質の構造・機能解析への応用を目指して〜, 園山 正史, 第39回 蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム, 2015年09月10日

「膜・タンパク質科学→膜タンパク質科学」への途：連携・融合・越境 ～含フッ素リン脂質を利用した膜タンパク質研究の展開～, 第３３回日本糖質学会年会, 2014年08月10日

フルオロアルキル基を導入した両親媒性分子集合体の開発, 園山 正史, 第41回生体分子科学討論会, 2014年06月07日

Development of partially fluorinated phospholipids as materials for membrane protein research, Masashi SONOYAMA, 7th International Conference on Structural Genomics, 2013年06月22日

ペルフルオロカーボンブロックの導入により物性・構造を制御した新規リン脂質分子集合体の開発 ～膜タンパク質の構造・機能解析への応用に向けて～, EIIRIS 特別セミナー, 2013年, 日本語

膜タンパク質研究における短鎖リン脂質・部分フッ素化リン脂質の利用, 園山 正史, GEヘルスケア BIA Symposium 2012 ワークショップ「膜タンパク質研究関連」, 2012年07月10日

膜タンパク質研究基盤の構築に向けた短鎖および部分フッ素化リン脂質の利用, 園山正史, 第12回日本蛋白質科学会年会 ワークショップ「先端的タンパク質研究のための実験技術」, 2012年06月20日

特許権, 擬環状脂質誘導体, 高木俊之; 金森敏幸; 園山正史, 特願2014- 048051, 2014年03月11日, 特許第6341479号, 2018年05月25日

特許権, 膜タンパク質の結晶化方法及び膜タンパク質結晶化剤, 奥津哲夫; 高橋 浩; 園山正史; 伊平 寛, 特願2013-045219, 2013年03月07日

JB論文賞（第17回）, 2009年